（1）生殖器畸型或發育異常常見的男性有隱睾、尿道狹窄、不育尿道瘺、需用尿道下裂、手术尿道上裂、治疗嚴重的陰莖硬結症等。

（2）梗阻性無精子症包括輸精管、精囊先天缺如引起的梗阻性無精子症；輸精管節段性不發育；輸精管醫源性損傷或結紮；射精管口先天性狹窄等。

（3）精索靜脈曲張在男性不育症中，精索靜脈曲張的發生率高達20%～3 5%，采用精索內靜脈高位結紮治療，可使部分病人恢複生育能力。

（4）器質性性功能障礙包括因陰莖嚴重創傷、骨盆骨折、血管性因素(如靜脈瘺)或神經性疾病引起的陽痿，以及一些因器質性病變引起的逆行射精患者。